温泉寺は、下呂冨士と呼ばれる中根山の中腹に位置し、下呂温泉の湧出を知らしめた白鷺に化身した薬師如来像を本尊とします。
下呂温泉は、草津温泉・有馬温泉と並ぶ日本三名泉に称されており、江戸時代には3万人の湯治客があったと言われています。
温泉寺はその歴史とともに歩んできました。当時の病気平癒の願掛けの絵馬が今も残っています。

毎年秋には紅葉ライトアップが行われ、多くの人でにぎわいます。